Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168 ms