Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDN4

Ccdc92, Coiled-coil domain-containing protein 92, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92Q8VDN4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc92Q8VDN4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc92Q8VDN4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc92Q8VDN4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc92Q8VDN4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc92Q8VDN4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc92Q8VDN4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc92Q8VDN4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc92Q8VDN4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc92Q8VDN4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc92Q8VDN4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc92Q8VDN4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc92Q8VDN4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms