Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms