Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nsl1Q8K305 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms