Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0V4

Cnot3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot3Q8K0V4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot3Q8K0V4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms