Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGK6

Ifnl3, Interferon lambda-3, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnl3Q8CGK6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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Ifnl3Q8CGK6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ifnl3Q8CGK6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ifnl3Q8CGK6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ifnl3Q8CGK6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ifnl3Q8CGK6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ifnl3Q8CGK6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ifnl3Q8CGK6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ifnl3Q8CGK6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ifnl3Q8CGK6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ifnl3Q8CGK6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ifnl3Q8CGK6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms