Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms