Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3B8

Rft1, Protein RFT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rft1Q8C3B8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rft1Q8C3B8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms