Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1W1

Vash1, Vasohibin-1, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vash1Q8C1W1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Vash1Q8C1W1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vash1Q8C1W1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vash1Q8C1W1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vash1Q8C1W1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vash1Q8C1W1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vash1Q8C1W1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vash1Q8C1W1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Vash1Q8C1W1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Vash1Q8C1W1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vash1Q8C1W1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vash1Q8C1W1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Vash1Q8C1W1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Vash1Q8C1W1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Vash1Q8C1W1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Vash1Q8C1W1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Vash1Q8C1W1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Vash1Q8C1W1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Vash1Q8C1W1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vash1Q8C1W1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vash1Q8C1W1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vash1Q8C1W1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vash1Q8C1W1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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