Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY89

Slc44a2, Choline transporter-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a2Q8BY89 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Slc44a2Q8BY89 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a2Q8BY89 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a2Q8BY89 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a2Q8BY89 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a2Q8BY89 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a2Q8BY89 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a2Q8BY89 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a2Q8BY89 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a2Q8BY89 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a2Q8BY89 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a2Q8BY89 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a2Q8BY89 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a2Q8BY89 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a2Q8BY89 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a2Q8BY89 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a2Q8BY89 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a2Q8BY89 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a2Q8BY89 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a2Q8BY89 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a2Q8BY89 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a2Q8BY89 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a2Q8BY89 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a2Q8BY89 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc44a2Q8BY89 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc44a2Q8BY89 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc44a2Q8BY89 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc44a2Q8BY89 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc44a2Q8BY89 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc44a2Q8BY89 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc44a2Q8BY89 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc44a2Q8BY89 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms