Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms