Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TtpaQ8BWP5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TtpaQ8BWP5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TtpaQ8BWP5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TtpaQ8BWP5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TtpaQ8BWP5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TtpaQ8BWP5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TtpaQ8BWP5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TtpaQ8BWP5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TtpaQ8BWP5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TtpaQ8BWP5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TtpaQ8BWP5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TtpaQ8BWP5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TtpaQ8BWP5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TtpaQ8BWP5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms