Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrfn4Q80XU8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms