Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms