Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf2Q7TMI3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms