Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg4Q7TMD7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms