Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Vma21Q78T54 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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Vma21Q78T54 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Vma21Q78T54 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Vma21Q78T54 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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