Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtifQ6PEE2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms