Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC061212Q6P8K3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms