Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms