Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nptx1Q62443 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms