Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prg2Q61878 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prg2Q61878 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prg2Q61878 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prg2Q61878 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prg2Q61878 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prg2Q61878 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prg2Q61878 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prg2Q61878 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prg2Q61878 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prg2Q61878 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prg2Q61878 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prg2Q61878 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prg2Q61878 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prg2Q61878 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prg2Q61878 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prg2Q61878 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms