Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms