Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sin3aQ60520 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms