Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms