Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbs12Q5SUD9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbs12Q5SUD9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbs12Q5SUD9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbs12Q5SUD9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbs12Q5SUD9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbs12Q5SUD9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbs12Q5SUD9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbs12Q5SUD9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbs12Q5SUD9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbs12Q5SUD9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbs12Q5SUD9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbs12Q5SUD9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbs12Q5SUD9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbs12Q5SUD9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbs12Q5SUD9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbs12Q5SUD9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbs12Q5SUD9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms