Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RilpQ5ND29 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RilpQ5ND29 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RilpQ5ND29 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RilpQ5ND29 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RilpQ5ND29 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RilpQ5ND29 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RilpQ5ND29 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RilpQ5ND29 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RilpQ5ND29 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RilpQ5ND29 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RilpQ5ND29 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RilpQ5ND29 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RilpQ5ND29 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RilpQ5ND29 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RilpQ5ND29 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RilpQ5ND29 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RilpQ5ND29 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RilpQ5ND29 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RilpQ5ND29 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RilpQ5ND29 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RilpQ5ND29 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RilpQ5ND29 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RilpQ5ND29 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RilpQ5ND29 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RilpQ5ND29 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RilpQ5ND29 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RilpQ5ND29 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RilpQ5ND29 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RilpQ5ND29 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RilpQ5ND29 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RilpQ5ND29 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RilpQ5ND29 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RilpQ5ND29 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RilpQ5ND29 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RilpQ5ND29 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms