Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms