Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc43Q3V0L5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc43Q3V0L5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc43Q3V0L5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc43Q3V0L5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc43Q3V0L5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc43Q3V0L5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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Lrrc43Q3V0L5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc43Q3V0L5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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Lrrc43Q3V0L5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrrc43Q3V0L5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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Lrrc43Q3V0L5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Lrrc43Q3V0L5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Lrrc43Q3V0L5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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Lrrc43Q3V0L5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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Lrrc43Q3V0L5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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Lrrc43Q3V0L5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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Lrrc43Q3V0L5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Lrrc43Q3V0L5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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