Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc114Q3UX62 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms