Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rmdn3Q3UJU9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rmdn3Q3UJU9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rmdn3Q3UJU9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rmdn3Q3UJU9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rmdn3Q3UJU9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rmdn3Q3UJU9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rmdn3Q3UJU9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms