Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hectd3Q3U487 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms