Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Gm1123Q1RME4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm1123Q1RME4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm1123Q1RME4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm1123Q1RME4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm1123Q1RME4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm1123Q1RME4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1123Q1RME4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm1123Q1RME4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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