Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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