Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms