Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfdP97946 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfdP97946 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfdP97946 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfdP97946 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfdP97946 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfdP97946 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VegfdP97946 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfdP97946 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms