Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmsP97355 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmsP97355 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmsP97355 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmsP97355 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmsP97355 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmsP97355 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SmsP97355 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmsP97355 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmsP97355 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmsP97355 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmsP97355 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmsP97355 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmsP97355 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmsP97355 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmsP97355 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmsP97355 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmsP97355 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmsP97355 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmsP97355 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmsP97355 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmsP97355 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmsP97355 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmsP97355 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmsP97355 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmsP97355 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmsP97355 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmsP97355 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmsP97355 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmsP97355 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SmsP97355 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SmsP97355 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmsP97355 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmsP97355 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmsP97355 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmsP97355 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmsP97355 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmsP97355 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmsP97355 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmsP97355 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmsP97355 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmsP97355 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmsP97355 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmsP97355 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmsP97355 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmsP97355 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmsP97355 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmsP97355 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SmsP97355 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmsP97355 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmsP97355 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmsP97355 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmsP97355 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmsP97355 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmsP97355 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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SmsP97355 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmsP97355 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmsP97355 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmsP97355 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmsP97355 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmsP97355 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmsP97355 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmsP97355 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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SmsP97355 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmsP97355 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmsP97355 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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SmsP97355 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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SmsP97355 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmsP97355 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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