Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Arf1P84078 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Arf1P84078 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Arf1P84078 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Arf1P84078 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Arf1P84078 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Arf1P84078 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Arf1P84078 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Arf1P84078 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Arf1P84078 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Arf1P84078 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Arf1P84078 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Arf1P84078 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Arf1P84078 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Arf1P84078 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Arf1P84078 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Arf1P84078 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Arf1P84078 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Arf1P84078 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arf1P84078 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arf1P84078 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arf1P84078 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arf1P84078 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Arf1P84078 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Arf1P84078 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arf1P84078 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Arf1P84078 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Arf1P84078 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Arf1P84078 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Arf1P84078 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Arf1P84078 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Arf1P84078 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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