Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufd1P70362 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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