Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbdP63072 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbdP63072 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbdP63072 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbdP63072 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbdP63072 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbdP63072 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbdP63072 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbdP63072 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbdP63072 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbdP63072 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbdP63072 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbdP63072 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbdP63072 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbdP63072 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbdP63072 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UbdP63072 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbdP63072 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbdP63072 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbdP63072 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbdP63072 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbdP63072 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbdP63072 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbdP63072 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbdP63072 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbdP63072 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbdP63072 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbdP63072 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbdP63072 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UbdP63072 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UbdP63072 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbdP63072 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbdP63072 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbdP63072 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbdP63072 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbdP63072 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UbdP63072 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbdP63072 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbdP63072 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbdP63072 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbdP63072 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbdP63072 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UbdP63072 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbdP63072 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbdP63072 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbdP63072 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbdP63072 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbdP63072 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbdP63072 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbdP63072 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbdP63072 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbdP63072 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbdP63072 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbdP63072 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbdP63072 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbdP63072 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbdP63072 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbdP63072 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbdP63072 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
UbdP63072 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbdP63072 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbdP63072 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbdP63072 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbdP63072 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbdP63072 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbdP63072 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbdP63072 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbdP63072 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UbdP63072 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UbdP63072 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UbdP63072 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UbdP63072 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UbdP63072 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UbdP63072 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UbdP63072 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UbdP63072 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UbdP63072 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UbdP63072 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UbdP63072 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UbdP63072 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UbdP63072 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UbdP63072 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UbdP63072 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UbdP63072 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UbdP63072 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UbdP63072 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UbdP63072 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UbdP63072 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UbdP63072 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UbdP63072 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UbdP63072 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UbdP63072 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UbdP63072 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UbdP63072 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UbdP63072 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UbdP63072 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UbdP63072 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UbdP63072 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UbdP63072 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UbdP63072 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms