Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtnsP57757 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtnsP57757 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtnsP57757 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtnsP57757 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtnsP57757 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtnsP57757 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtnsP57757 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtnsP57757 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtnsP57757 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms