Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NcstnP57716 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NcstnP57716 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NcstnP57716 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NcstnP57716 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NcstnP57716 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NcstnP57716 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NcstnP57716 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NcstnP57716 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms