Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc12a1P55014 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms