Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acod1P54987 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acod1P54987 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Acod1P54987 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acod1P54987 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acod1P54987 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acod1P54987 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Acod1P54987 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Acod1P54987 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acod1P54987 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms