Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms