Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1cP52432 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1cP52432 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms