Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms