Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpreP49446 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpreP49446 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpreP49446 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpreP49446 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtpreP49446 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtpreP49446 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpreP49446 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpreP49446 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpreP49446 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PtpreP49446 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtpreP49446 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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