Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rab11bP46638 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rab11bP46638 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rab11bP46638 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rab11bP46638 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rab11bP46638 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rab11bP46638 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rab11bP46638 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rab11bP46638 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rab11bP46638 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rab11bP46638 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rab11bP46638 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rab11bP46638 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rab11bP46638 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rab11bP46638 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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