Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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